Алкоголизм и COVID-19 можно лечить одним препаратом
Одна называется лиганд (лекарственное вещество), а вторая — рецептор (активный центр) белка-мишени, например, Mpro, с которым может произойти «стыковка». В простых случаях для молекулярного моделирования используется процедура докинга — «стыковки», в которой участвуют две молекулы. Классический вариант докинга по отношению к SARS-CoV-2 не работает, поэтому химики из НИУ ВШЭ и Института органической химии имени Зелинского РАН решили применить новый принцип «докинга по поверхности». Эффективный препарат связывается с активным центром с помощью ковалентных связей, что делает фермент недееспособным либо приводит к его разрушению.
Лучшие кандидаты для этого — консервативные белки, такие как главная протеаза коронавируса (Mpro). В качестве «мишени» для лекарства выбирают такие структурные элементы коронавируса, которые меньше всего подвержены мутациям в ходе эволюции, иначе препарат, работающий против одного штамма, не будет эффективен против другого. Кроме того, что он устойчив к мутациям, Mpro играет важнейшую роль в репликации коронавируса, а значит блокирование функции данного фермента способно замедлить или полностью приостановить его размножение внутри организма.
Его недостаток может привести к тяжёлому течению заболевания. Дисульфирам противодействует SARS-CoV-2 двумя основными способами: он является ковалентным ингибитором и борется с таким симптомом COVID-19, как сокращение в организме редуцированных форм глутатиона — важного антиоксиданта. Помимо дисульфирама, российские химики впервые спрогнозировали потенциальную эффективность против SARS-CoV-2 необратимого ингибитора тирозинкиназы нератиниба — FDA недавно одобрило нератиниб в качестве вспомогательной терапии при раке молочных желёз.
Потенциальные препараты для проверки брались из базы лекарственных средств, одобренных Бюро по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA). В работе использовалась установленная в январе 2020 года структура Mpro самого SARS-CoV-2 из базы данных PDB (код 6LU7). Выяснилось, что высокую эффективность в качестве лиганда для активного центра главной протеазы коронавируса (Mpro) проявляют препараты, содержащие серу. Для моделирования применялись собственные алгоритмы исследовательской группы. Однако только дисульфирам, который используют для борьбы с алкоголизмом, показал наиболее стабильное взаимодействие.
Дисульфирам, вероятно, может блокировать ферментативную активность Mpro реакцией тиол-дисульфидного обмена, а связывание нератиниба предполагает возможность ковалентного взаимодействия аналогично ковалентным пептидным ингибиторам. Оба потенциальных ингибитора главной протеазы коронавируса (Mpro) предположительно ковалентны. Увы, нератиниб, хотя и показал активность к Mpro, оказался недостаточно эффективным для применения в лечебной практике. Тесты в сертифицированной лаборатории Reaction Biology в США показали, что дисульфирам действительно ингибирует Mpro в концентрации 100 нм, что подтвердило результаты моделирования.
Дата публикации: 05.08.2020
Ещё новости
26.08.2022 20 000 потоковых процессоров, 36 ГБ памяти и шина разрядностью 512 бит. AMD работает над видеокартой-монстром, но она выйдет нескоро
Информатор приписывает ей компоновку с 13 (!) чиплетами: четырьмя модулями GCD (Graphics Compute Dies) и девятью MCD (Memory Complex Dies). Инсайдер принес очень интересные новости относительно перспе...
27.08.2022 Власти Италии обратились к экстрасенсу, чтобы тот спас всех от засухи
Такое решение вызвано серьезными последствиями аномальной жары лета 2022 года: два из пяти источников воды коммуны пересохли. В северном регионе Италии, коммуна Баярдо, Лигурия, местные власти обрати...
27.08.2022 В океане обнаружены колоссальные залежи сахара, о существовании которых не знали даже эксперты
Это означает, что концентрация сахара на морском дне примерно в 80 раз выше, чем в обычной почве. Сахар поступает в виде сахарозы (основного ингредиента сахара, используемого на кухне), и высвобождает...
26.08.2022 Флагман Xiaomi возвращается к истокам. Xiaomi 13 получит плоский экран впервые с момента выпуска Xiaomi Mi 9
Последним флагманом компании с плоским экраном был Xiaomi Mi 9. По данным инсайдера, известного под ником Digital Chat Station, будущий флагман Xiaomi — Xiaomi 13 — получит плоский экран. ...
30.09.2022 В следующем году Micron Technology резко сократит капитальные затраты
Особенно в части покупки производственного оборудования. Особенно в части покупки производственного оборудования. Предвидя это, Micron собирается сократить капитальные затраты в следующем году н...
Все новости